Sofia på Måkøya handler om Sofia, som forlater trygge i Oslo, og flytter til Måkøya. Sofia forlater venner og familie for å jobbe som lærervikar på en øy i Finnmark. Året er 1964, og på Måkøya er de uvante med miniskjørt og selvsikre byjenter. Sofia møter fordommer og sjalusi, men også den barske fiskeren Magnus.